基因工程专业的大学排名如下：

北京大学

清华大学

上海交通大学

中国农业大学

南京大学

中国科学技术大学

武汉大学

华中农业大学

复旦大学

浙江大学

华南理工大学

西安交通大学

南开大学

东北师范大学

这些排名基于学术声誉、教育质量、师资力量、科研成果和学生竞争力等因素进行评估。请注意，排名可能会根据不同的标准和评估机构有所变化。建议查阅最近的官方发布或教育评估机构的数据以获取最新信息。