根据最新的教育部排名信息，自动化专业的排名如下：

清华大学

浙江大学

哈尔滨工业大学

这些大学在自动化专业方面被评为S级，属于全国自动化专业前三名。

其他进入全国排名前2%的高校包括：

上海交通大学

北京航空航天大学

北京理工大学

西安交通大学

东北大学

东南大学

进入全国排名前10%的高校有：

华中科技大学

中南大学

中国科学技术大学

这些排名信息基于最近发布的数据，因此可能会随着时间的推移而有所变化。建议参考最新的教育部官方公告或权威排名机构发布的最新数据，以获取最准确的信息。