以下是日本在水质专业方面排名较高的大学列表：

国立大学

东京海洋大学：专注于海洋生物资源研究。

北海道大学：在水产领域有很高的排名。

长崎大学：水产专业表现突出。

宫崎大学：在海洋生物环境科学方面排名靠前。

福井县立大学：海洋生物资源研究较为出色。

鹿儿岛大学：在水产资源科学、水产食品科学和水圈科学方面表现优异。

私立大学

近畿大学：水产专业评价较高。

这些大学在水质专业领域都有各自的优势和研究方向，建议根据具体的研究兴趣和职业规划选择合适的大学。