根据最新的排名，全国应用物理学专业最好的大学如下：

北京大学（排名第1）

清华大学（排名第2）

中国科学技术大学（排名第3）

复旦大学（排名第4）

上海交通大学（排名第5）

南京大学（排名第6）

南开大学（排名第7）

吉林大学（排名第8）

浙江大学（排名第9）

武汉大学（排名第10）

这些大学在应用物理学领域具有很高的教学和研究水平，为学生提供了良好的学习环境和实践机会。

建议：

北京大学和 清华大学作为顶尖学府，拥有最强的师资力量和科研实力，适合追求最高学术水平的同学。

中国科学技术大学在物理学领域有深厚的科研积累，适合希望深入研究物理学的同学。

复旦大学、 上海交通大学和 南京大学等综合性大学在应用物理学方面也有很强的实力，适合希望在不同领域应用物理学的同学。

吉林大学、 浙江大学和 武汉大学等地方重点大学在应用物理学方面也有较好的教学和科研条件，适合希望在当地有较好发展机会的同学。