以下是日本手风琴专业排名较高的几所大学：

东京艺术大学

音乐学部：提供乐器科（包括风琴）。

研究生院：设有乐器专攻。

国立音乐大学

音乐学部：演奏学科和音乐教育学科。

研究生院：设有器乐专攻。

东京音乐大学

本科：乐器专攻（包括风琴）。

桐朋学园大学

专业领域：弦乐专业和指挥专业特别强，代表专业包括作曲、指挥、弦乐、钢琴等。

这些大学在手风琴专业方面都有较高的教学水平和研究实力，建议根据个人兴趣和职业规划选择合适的学校。