楚雄医药高等专科学校有药学系、检验系、医学系、护理系、基础医学系、继续教育系、马克思主义学院等院系，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。

院系设置

药学系

检验系

医学系

护理系

基础医学系

继续教育系

马克思主义学院

楚雄医药高等专科学校简介

楚雄医药高等专科学校（Chuxiong medical and pharmaceutical College）位于云南省楚雄市，是由楚雄彝族自治州人民政府主办、经中华人民共和国教育批准设立的全日制公办普通高等专科院校，学校是全国第二批“1+X”证书制度试点院校、云南省特色骨干专科学校。

学校前身是始建于1950年的上海市卫生学校，1970年迁至楚雄后改名为云南省楚雄卫生学校，2006年学校升格并更名为楚雄医药高等专科学校。