南开大学医学系的录取分数线每年都有所变动，具体取决于当年的招生计划和报考人数。通常情况下，医学专业的录取分数线较高。以下是一些具体的分数线信息：

理科生 ：通常需要达到本省理科一本线以上，有的年份甚至需要超过本省理科一本线50分以上。

文科生：

通常需要达到本省文科一本线以上，有的年份甚至需要超过本省文科一本线30分以上。

临床医学专业

四川：660分。

山东：660分。

浙江：667分。

河北：652分。

其他专业

生理学：544分。

口腔医学：330分。

临床医学专业学位：350分。

口腔医学专业学位：330分。

建议您通过南开大学医学院官网或相关教育部门发布的最新信息来了解具体的分数线，因为每年的分数线可能会有所不同。