菏泽学院最好专业排名如下：

环境科学与工程

全国排名：第2名

星级排名：A+

办学层次：中国一流应用型专业

机械电子工程

全国排名：第15名

星级排名：A

办学层次：中国一流应用型专业

能源化学工程

全国排名：第4名

星级排名：A+

办学层次：中国高水平应用型专业

制药工程

全国排名：第23名

星级排名：A+

办学层次：中国高水平应用型专业

汉语言文学（师范类）

投档线：508分

推荐指数：4.4（121人推荐）

历史学（师范类）

投档线：506分

推荐指数：4.3（87人推荐）

英语（师范类）

投档线：502分

推荐指数：4.3（85人推荐）

思想政治教育（师范类）

投档线：500分

推荐指数：4.1（65人推荐）

生物科学（师范类）

投档线：499分

推荐指数：4.3（85人推荐）

心理学（师范类）

投档线：498分

推荐指数：4.3（82人推荐）

化学（师范类）

投档线：496分

推荐指数：4.2（82人推荐）

特殊教育（师范类）

投档线：494分

推荐指数：4.2（82人推荐）

数学与应用数学（师范类）

投档线：491分

推荐指数：4.2（82人推荐）

财务管理

投档线：489分

推荐指数：4.5（77人推荐）

体育教育

省级一流本科专业

推荐指数：4.3（85人推荐）

艺术设计

推荐指数：4.2（82人推荐）

生物工程

省级卓越工程师培养计划专业项目

推荐指数：4.2（82人推荐）

音乐学

省级一流本科专业

推荐指数：4.2（82人推荐）

自动化

省级一流本科专业

推荐指数：4.2（82人推荐）

这些专业在学术排名、投档线以及学生推荐指数等方面均表现出色，是菏泽学院的亮点专业。建议学生在选择专业时，可以优先考虑这些专业，以获得更好的学术发展和就业前景。