以下是合肥最好的5个专业：

中国科学技术大学

王牌专业：

主要集中在理科，如数学、物理、化学等。

合肥工业大学

王牌专业：

以工科见长，包括机械设计制造及其自动化、材料成型及控制工程、车辆工程、测控技术与仪器、新能源材料与器件、电气工程及其自动化、物联网工程、土木工程、制药工程、资源勘查工程、食品科学与工程、建筑学、信息管理与信息系统等。

合肥学院

国家级一流本科专业：

包括机械设计制造及其自动化、计算机科学与技术、土木工程、化学工程与工艺等。

省级特色专业：化学工程与工艺、物流管理、经济工程、动画专业、会计学、通信工程、旅游管理等。

安徽大学

王牌专业：

金融工程、思想政治教育、信息与计算科学、机械设计制造及其自动化、车辆工程、测控技术与仪器、金属材料工程、电气工程及其自动化、电子信息工程、自动化等。

合肥通用职业技术学院

王牌专业：

制冷与空调技术、机械制造与自动化、机械产品检测检验技术、机电一体化技术、数控技术、模具设计与制造、安全技术与管理、理化测试与质检技术、电气自动化技术、应用电子技术等。

这些专业在各自的领域内具有很高的声誉和影响力，无论是学术实力还是就业前景都非常看好。建议学生在选择专业时，可以根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑这些学校的王牌专业和优势学科。