截至2025年，南京市共有 58所大学。其中包括：

1. 南京大学

2. 东南大学

3. 河海大学

4. 南京理工大学

5. 南京航空航天大学

6. 南京师范大学

7. 南京财经大学

8. 南京农业大学

9. 中国药科大学

10. 南京林业学院

11. 南京工程学院

12. 南京信息工程大学

13. 南京中医药大学

14. 南京医科大学

15. 南京铁道职业技术学院

16. 南京艺术学院

17. 南京大学金陵学院

18. 中国人民解放军陆军工程大学

19. 东南大学成贤学院

20. 南京航空航天大学金城学院

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