山东省96个志愿的投档规则如下：

位次优先：

在高考分数公布后，省教育招生考试院会发布一分一段表，显示每个分数段对应的位次。在投档时，系统会按照考生的位次从高到低进行检索，位次越靠前的考生优先被检索。

遵循志愿：

在检索到每个考生时，系统会依据考生填报的96个志愿顺序依次进行检索。如果考生的第一个志愿符合条件，则投档，不符合条件则继续检索第二个志愿，以此类推。一旦检索到符合条件的志愿并投档，后续志愿即失效。

一轮投档：

专业平行志愿实行一轮投档，考生只有一次投档机会。如果考生投档了某个专业志愿但因不符合条件被退档，或者因为96个志愿都没能投进而导致滑档，都只能参加征集志愿或下一批次志愿。

分数优先：

在投档时，系统会先依次检索高分考生的1-96个志愿，一旦有符合条件的专业志愿就会投档，然后再检索次高分考生的1-96个志愿，以此类推。

一次投档：

平行志愿按招生计划1:1投档，没有虚数。因此，投档后不会因分数（位次）低被退档，只有在有正当理由（如专业要求色盲、色弱考生限报）的情况下，才能退档。

综上所述，山东省96个志愿的投档规则是“位次优先，遵循志愿，一轮投档”，并且强调分数优先和一次投档的原则。考生在填报志愿时，应合理安排志愿的次序，掌握冲稳保的梯度，以确保能够被理想的院校和专业录取。