清华大学在全国的档次划分中，可以得出以下结论：

第一档次：

清华大学和北京大学。这两所学校被认为是国内最顶尖的大学，属于985、211和双一流大学，历史悠久，师资力量雄厚，学术研究水平世界领先。

第二档次：

包括中国人民大学、中国科学技术大学、浙江大学、复旦大学、南京大学和上海交通大学，这些学校在国内的知名度和实力仅次于清华和北大，被称为顶级985大学。

第三档次：

包括北京师范大学、北京航空航天大学、武汉大学、哈尔滨工业大学和西安交通大学等，这些学校在国内外都有较高的知名度，并在各自的领域表现出色。

综合以上信息，可以认为清华大学在全国的档次非常高，属于顶尖的985高校，并且在全国大学排名中通常位居前两名。