兖州至少有一所大学，即兖州开放大学。此外，兖州还有以下大学：

兖州大学

兖州矿区职工大学

山东广播电视大学兖州学院

济宁学院

济宁学院兖州师范校区

曲阜师范学校兖州校区

济宁学院学前教育学院（兖州师范校区）

山东理工职业学院曲阜校区

曲阜师范大学国际文化交流学院

曲阜师范大学文学院

曲阜师范大学体育科学学院

孔子文化大学

兖州职业技术学院

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