高考选择小语种有以下缺点：

基础薄弱，学习时间紧迫

选择小语种的考生通常是从高中开始学习，与从小学开始学习英语的考生相比，他们的语言基础较为薄弱。因此，学习小语种需要更加紧迫的时间安排和更多的努力来达到高考要求。

大学专业选择受限

虽然小语种专业在报考时有一定的优势，但有些专业如军校、师范、国防、英语文学等以及明确要求英语考生报考的专业无法报考。这限制了小语种考生的专业选择范围。

后期英语学习吃力

高中学习小语种意味着比其他考生少学三年的英语，这会导致英语基础相对薄弱。在大学期间，许多课程需要使用英语授课，并且许多企业要求毕业生具备英语四级或六级水平，因此小语种考生在后期英语学习上会面临较大挑战。

学习负担增加

学习小语种需要投入更多的时间和精力，这可能会对其他科目的学习产生影响，导致学生在其他科目上的表现下降。此外，小语种的考试难度较大，对学生的能力要求较高。

经济负担

全国大部分高中选择小语种高考需要另外收费，费用大约在每年1.2—3万元之间，这会增加学生的经济负担。

就业竞争

小语种虽然可以提供更多的专业选择，但由于其不具有广泛性，就业时可能会面临一定的竞争压力。

综上所述，选择小语种参加高考虽然有一定的优势，但考生需要付出更多的时间和精力，并且在专业选择和后期学习上会面临一定的限制和挑战。因此，考生在选择小语种时，需要综合考虑自身的语言基础、学习能力和职业规划，做出明智的决策。