山东省至少有两所副部级大学，分别是：

山东大学：

山东大学是中国教育部直属的综合性全国重点大学，是国家“211工程”、“985工程”重点建设院校，入选“111计划”、“珠峰计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“卓越医生教育培养计划”、“卓越法律人才教育培养计划”，是中央直接管理的副部级大学。

中国海洋大学：

中国海洋大学是教育部直属的重点院校，也是中央直管的副部级大学，拥有海洋科学与水产养殖学两个世界学科。

因此，山东大学和中国海洋大学是山东省内的两所副部级大学。