城轨专业最好的学校包括以下几所：

北京航空航天大学：

国内顶尖高校，城轨专业就业率高，属于“铁饭碗”工作。

浙江大学：

城轨专业实力不错，专业建设速度快，注重城市环境的协调发展。

北京大学：

国内顶尖高校，城轨专业多元化，注重理论与实践的结合。

中南大学：

城轨专业实力强，专业建设速度快，注重城市环境的协调发展。

西南交通大学：

教育部、中国铁路总公司、四川省和成都市共建的全国重点大学，城轨专业表现突出，拥有丰富的教学资源和实践机会。

北京交通大学：

国家“211工程”和“985工程优势学科创新平台”高校，城轨专业表现突出，拥有丰富的教学资源和实践机会。

华南理工大学：

城轨专业实力强，专业课程设置完善，师资力量雄厚。

上海交通大学：

城轨专业实力强，专业课程设置完善，师资力量雄厚。

同济大学：

拥有铁道与城市轨道交通研究院，提供全面的城轨专业教育，轨道交通工程专业在国内外享有盛誉。

东南大学：

轨道交通工程研究和教育的重要基地之一，专业在国内外也有较好的声誉。

这些学校在城轨专业方面都有很强的实力和良好的声誉，具体选择哪所学校还需根据个人兴趣、职业规划以及学校的具体情况进行综合考虑。