南京理工大学最吃香的三个专业如下：

计算机科学与技术：

该专业培养的人才在计算机行业具有很高的竞争力，毕业生主要从事软件开发、网络工程、数据分析等领域的工作。该专业的毕业生就业率通常超过95%。

电子信息工程：

该专业培养的人才在电子信息技术领域具有广泛的就业前景，毕业生主要从事电子信息系统的设计、开发、维护等工作。该专业的毕业生就业率通常超过96%。

武器系统与工程：

该专业在第四轮和第五轮学科评估中均获得A+评级，在第五轮评估中名列全国第一。该专业涵盖武器设计、制造、测试等多个环节，培养出的学生不仅理论知识扎实，还具备丰富的实践经验和创新思维。

建议：

计算机科学与技术和 电子信息工程是南理工的热门专业，就业前景广阔，适合希望进入信息技术领域的学生。

武器系统与工程则是南京理工大学的王牌专业，学科评估成绩优异，适合对武器系统和工程有浓厚兴趣的学生。