南京工业大学最好就业的专业主要包括以下几个：

化学工程与工艺：

该专业是南京工业大学的王牌专业之一，也是国家级特色专业。它培养具备化工生产过程设计、优化与管理能力的高素质人才，近年来，随着化工行业的快速发展，该专业毕业生备受青睐。

材料科学与工程：

作为南京工业大学的传统优势专业，研究方向涵盖金属材料、无机非金属材料、高分子材料等。随着新材料产业的崛起，该专业毕业生成为各大企业的抢手人才。

电气工程及其自动化：

该专业是南京工业大学的热门工科专业，研究方向涵盖电力系统、自动化控制、智能制造等。随着工业4.0时代的到来，该专业毕业生成为智能制造领域的核心力量。

过程装备与控制工程：

该专业在全国排名靠前，被评为A+等级，毕业生在化工、石油、制药等行业需求量大，就业前景广阔。

土木工程：

土木工程专业在同类院校中排名较高，大型国企如中铁、中建等喜欢招聘该专业的毕业生。

计算机科学与技术：

专业学生具备较强的动手能力，理论实践相结合，在信息技术行业有较好的发展机会。

环境工程：

随着国家对环保问题的重视，环境工程专业毕业生在未来十年内需求量大，就业前景看好。

安全工程：

随着社会对安全生产的重视，安全工程专业的毕业生在安全监察、风险评估等领域有稳定的需求。

生物工程：

该专业在生物制药、生物技术等领域有广阔的应用前景，毕业生在医药、环保等行业有较多的就业机会。

这些专业不仅在学术上享有盛誉，而且在就业市场上也极具竞争力。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，选择这些就业前景较好的专业。