哈尔滨工程大学目前设有 16个院系，共有 56个专业。具体专业设置如下：

船舶与海洋结构物设计制造

水声工程

轮机工程

船舶与海洋工程

核科学与技术

计算机科学与技术

信息与通信工程

控制科学与工程

仪器科学与技术

机械工程

材料科学与工程

动力工程及工程热物理

力学

光学工程

管理科学与工程

此外，哈尔滨工程大学还设有计算机科学与技术学院，该学院起源于“哈军工”计算机系，拥有计算机科学与技术和软件工程2个一级学科博士点和硕士点，1个计算机科学与技术博士后科研流动站，以及计算机科学与技术和软件工程2个一级学科硕士点，计算机技术和软件工程2个工程硕士领域，以及计算机科学与技术、信息安全、软件工程、网络工程4个本科专业。

建议您访问哈尔滨工程大学官网，以获取更详细和最新的专业设置信息。