北安市目前拥有的高等教育机构包括：

1. 黑龙江护理高等专科学校北安校区

2. 北安市职业技术学校

3. 黑龙江农垦机械化学校

4. 与中国人民解放军国防科技大学、中国人民解放军陆军工程大学、中国人民解放军海军工程大学、海军大连舰艇学院等军事院校的合作关系

5. 与东北农业大学、黑龙江大学等7所高校的合作协议

综上所述，北安市至少拥有一所高等教育机构，并与多所高校建立了合作关系。