河南历史上拒绝的高校落户请求至少包括以下几所：

1.  中国科学技术大学：在1969年，中国科技大学希望迁往河南南阳，但被河南拒绝。

2.  中国矿业大学：中国矿业大学曾有意落户河南焦作，但被河南拒绝。

3.  中国地质大学：中国地质大学曾想搬到河南平顶山，但被河南拒绝。

4.  对外经济贸易大学：虽然最终落户河南，但在早期也曾被考虑拒绝。

综上所述，河南至少拒绝了四所顶尖高校的落户请求。这些拒绝可能与当时河南省的经济困难有关。