香港在深圳设有分校的大学包括：

香港中文大学（深圳）：

提供本科、硕士和博士研究生教育，位于深圳市龙岗区。

香港科技大学（深圳）：

提供本科和研究生教育。

香港大学：

在深圳市南山区设立了香港大学深圳校区，旨在建设一所面向世界的一流综合性研究型大学。

因此，香港在深圳的大学至少有 三所分校。