给堂妹上大学的红包金额应根据以下因素来决定：

经济条件：

红包金额应视个人或家庭的经济能力而定。如果经济条件较好，可以考虑给堂妹一个较大的红包，如1000-5000元不等。如果经济条件一般，可以选择给200-500元。

关系亲疏：

与堂妹的关系越近，可以给予相对较多的礼金。如果平时关系较好且走动频繁，可以考虑给5000元或更多。如果关系一般，可以根据自己的经济能力包2000元或稍多一些。

地区习俗：

不同地区可能有不同的风俗习惯，应考虑当地的标准。例如，有些地方可能习惯给较大的红包，而有些地方则可能更倾向于给一些象征性的金额。

个人意愿：

最重要的是表达出祝福和喜悦的心意。可以选择一些吉祥的数字，如666元、888元等，以表达对堂妹学业有成的美好祝愿。

综合以上因素，如果经济条件允许且与堂妹关系较好，可以考虑给堂妹一个5000元左右的红包。如果经济条件一般，可以选择给2000-500元之间的金额，并尽量选择一个吉祥的数字以表达祝福。