南京理工大学电光学院的专业选择主要推荐以下两个专业：

通信与信息系统

通信与信息系统是电光院考研考生招生人数最多的专业之一，本科阶段通信工程也是一个非常热门的专业。

如果你对电磁场、微波等技术感兴趣，通信工程是一个很好的选择。

光学工程

光学工程是电光院最强的本科专业，也是国家重点一级学科，全国排名前十。

光学工程包含材料学、电磁场与微波技术、模式识别与智能系统、化学等多个方向，就业前景广阔。

虽然微电子专业发展迅速，但南理工的微电子专业相对其他两个专业可能稍逊一筹，不过就业情况依然较好。

建议

如果你对通信系统和电磁场技术感兴趣， 通信与信息系统是一个很好的选择。

如果你希望从事光学工程领域的研究和应用， 光学工程会是一个更有前景的专业。

根据你的兴趣和职业规划，可以选择以上两个专业中的一个进行深入学习。