研究清朝文献，可以选择以下专业：

清史专业

中国人民大学：清史是其特色学科之一，设有清史研究所，并在历史地理等方面有深入研究。

北京大学：历史学系历史悠久，实力强劲，涵盖中国古代史、中国近现代史等多个领域。

古典文献学

古典文献学是中国普通高等学校本科专业，属于文学类，基本修业年限为四年。本专业培养掌握古籍整理、古典文献学的基本知识、理论，具有较强的古典文献整理与研究能力，从事与文学、史学、汉语言文献运用相关工作的中国语言文学学科应用型人才。

历史文献学

历史文献学的研究对象主要是古今一切有历史价值的汉文与民族文字的历史文献，探讨文献的产生发展、表现方式、流传情况，以及文献的内容类别、整理利用乃至文献数据化。

中国语言文学

中国语言文学专业包含古代文学、古典文学理论等课程，适合对古典文学有浓厚兴趣的学生。该专业会学习《资治通鉴》等古典文献。

历史学

历史学专业研究中国古代历史，与国学中的史学部分密切相关。该专业也会涉及《资治通鉴》的学习。

中国古典学

中国古典学本科专业专注于中国古代经典的研究，包括古代文献、文化遗产、古代文化等方面的系统学习与研究。

中文系

中文系通常包含古代文学、古典文学理论等课程，适合对古典文学有浓厚兴趣的学生。

哲学系

哲学系研究中国古代哲学思想，与国学中的哲学部分密切相关。

建议

兴趣导向：如果对清朝文献的具体内容和研究方法有浓厚兴趣，可以选择古典文献学或历史文献学专业。

学术背景：如果具有扎实的中国语言文学基础，古典文献学专业可能更适合。如果对历史学研究有浓厚兴趣，可以选择历史学专业。

职业规划：考虑未来的职业发展方向，如高等院校、科研机构、政府机关、新闻单位、出版机构、图书馆、企业等，选择与之相关的专业。

这些专业都能提供对清朝文献的深入研究，具体选择哪个专业还需根据个人兴趣和职业规划来决定。