钟南山选择医学专业的原因主要可以归结为以下几点：

对体育的热爱与理性评估：

钟南山虽然热爱体育，并在1959年第一届全国运动会上打破了男子400米栏的全国纪录，但他清楚地认识到自己的体质和天赋有限，成为亚洲级别的运动员已经是极限，而医学事业则能给他带来更大的发展空间和成就感。

身体条件限制：

钟南山自认为身体条件不适合从事高强度的体育运动，尽管在运动队里待遇很好，但他认为运动员的道路没有前途，因此决定转向医学领域。

家庭背景与影响：

钟南山出身于医学世家，父亲钟世藩是儿科泰斗，母亲是肿瘤医院创始人，这样的家庭背景让他从小就对医学产生了浓厚的兴趣，并听从了父亲的建议考入北京医学院。

医学的长远意义：

钟南山认为医学尽管道路漫长且充满未知，但更具长远意义，能够给予他更大的发展空间和成就感。他宁愿选择一条充满挑战的医学之路，也不愿在运动领域止步不前。

个人追求与使命感：

钟南山在运动中展示了勇于拼搏的精神，在医学中同样如此。他希望在医学领域能够治病救人，实现自己的人生价值。

综上所述，钟南山选择医学专业是由于他对体育的热爱与理性评估、身体条件的限制、家庭背景的影响、对医学长远意义的认识以及个人追求与使命感等多方面因素的综合考量。