南京市拥有 13所双一流大学，其中包括：

1.  南京大学

2.  东南大学

3.  南京航空航天大学

4.  南京理工大学

5.  南京农业大学

6.  南京师范大学

此外，南京市还有多所在国内具有较高知名度的大学，例如河海大学、南京工业大学、南京邮电大学、南京信息工程大学、南京医科大学、南京中医药大学、中国药科大学、南京财经大学等。