南京市的本科院校数量如下：

南京大学

东南大学

南京航空航天大学

南京理工大学

南京工业大学

南京邮电大学

河海大学

南京林业大学

南京信息工程大学

南京农业大学

南京医科大学

南京中医药大学

中国药科大学

南京师范大学

南京财经大学

江苏警官学院

南京体育学院

南京艺术学院

南京工业职业技术大学

南京工程学院

南京晓庄学院

南京审计学院

江苏城市职业学院（虽然为高职院校，但属于本科院校序列）

总计有 35所本科院校。

建议：

由于大学数量和状态可能会有变化，建议在需要最新和详细信息的场合，进一步核实相关数据来源。