吉林高考志愿的投档流程主要包括以下步骤：

模拟投档：

在正式投档前，进行模拟投档，以确定各高校的投档比例和考生投档的起始位置。

确定投档比例：

根据模拟投档的结果，相关部门会确定各高校的投档比例，并将这一信息传达给高校。

考生投档：

在投档时间内，考生根据自己的志愿顺序，将电子档案提交给省招办。投档时，按照“分数优先，遵循志愿”的原则进行，即高分考生优先投档，然后依次检索考生所填的院校专业组志愿。

高校阅档：

高校收到电子档案后，工作人员会阅档，审核考生的志愿选择、考试成绩、排名位次、身体情况等内容，进行录取或调剂。

高校预录取：

高校在阅档后，进行预录取，并将预录取信息返还给省招办进行复核。如有问题，则进行更正，无误后确定最终录取名单。

确定名单寄送通知书：

预录取工作结束后，省招办会确定最终录取名单，并盖章发给高校。高校随后会按照要求寄送录取通知书。

在投档过程中，还有一些具体的规则和注意事项：

平行志愿投档：以院校专业组为投档单位，按考生投档分从高分到低分排序，依次检索考生所填院校专业组志愿，符合投档条件的即向该院校专业组投档。如果考生投档到某院校某一专业组后，选择了服从专业调剂，只能在院校专业组的招生专业范围内进行调剂，不能调剂到其他院校专业组。

一次投档原则：一旦考生的档案被投给某高校，后续的志愿即失效，即使因某种原因被退档，也不再补投到其他院校专业组志愿，只能参加征集志愿或下一批次录取。

同分排序规则：在投档成绩相同时，普通类考生依次按语文数学两科之和、语文或数学单科最高成绩、外语单科成绩、首选科目单科成绩、再选科目单科最高成绩、再选科目单科次高成绩由高到低排序投档。艺术类、体育类考生也按照类似的规则进行排序。

这些规则和流程确保了高考志愿投档的公平、公正和透明。考生在填报志愿时，应充分了解相关规则，合理组合院校志愿，以提高被录取的机会。