选择新疆军校的专业时，你可以从以下几个方面进行考虑：

兴趣和特长

如果你对军事指挥和管理有浓厚兴趣，希望成为军事领导者，可以选择指挥类专业。

如果你对特定技术领域有浓厚兴趣，希望在军队技术和服务领域发展，可以选择非指挥类专业。

身体素质

某些专业对身体素质有特定要求，例如指挥专业可能要求裸眼视力达到一定标准。

军种和专业要求

不同军兵种有不同的使命和任务，选择时要考虑自己的兴趣与军种是否匹配。

指挥类专业和非指挥类专业对身体素质的要求不同，选择时要根据自身条件进行选择。

发展前景

指挥类专业毕业生通常在行政岗位工作，有较好的晋升机会。

非指挥类专业毕业生主要在专业技术岗位工作，晋升可能相对缓慢。

体检结果

指挥类专业的体检要求通常比非指挥类专业高。

专业方向

指挥类专业培养军事管理人才，非指挥类专业培养专业技术人才。

个人情况

考虑自己的性格、学习能力和未来职业规划。

学科组合

选择物理、化学、生物组合可报考大部分专业。若有意向上军医学院，可选择化学、生物、政治组合。

军队需求

了解我国军队对各类人才的需求，不同的军种和岗位对人才的专业背景有不同的要求。

职业发展前景

考虑专业的长远发展前景，选择具有长期发展潜力的专业，有助于在军队中的长期发展。

指技融合类

今年军校招生方向中增加了指技融合类，即毕业后可根据需要从事指挥与技术岗位。这类专业适合分数较高且有从事科研意愿的考生。

军地通用专业

如果想在部队长期发展，建议选择技术含量比较高、培养周期长的军种和专业，并且选择军地通用的专业，这样在部队能用得上，回到地方以后也能用。

职业资格证书

在入伍期间，考虑一些相关的职业资格证书，这有利于回到地方就业，甚至拿到高薪的工作。

综合以上因素，你可以更全面地评估和选择适合自己的军校专业。建议多咨询老师、学长学姐的意见，并查阅相关军校的官方招生信息，以便做出更明智的选择。