清朝时期，中国共有 21所教会大学。这些大学中，有17所是由基督教创设的，它们分别是：

1. 齐鲁大学

2. 东吴大学

3. 之江大学

4. 圣约翰大学

5. 华西协和大学

6. 北京协和医学院

7. 沪江大学

8. 华南女子文理学院

9. 金陵大学

10. 岭南大学

11. 金陵女子文理学院

12. 燕京大学

13. 福建协和大学

14. 武昌文华图书馆专科学校

15. 华中大学

此外，清政府在其统治期间，至少创办了10所大学，其中包括：

1. 京师大学堂（北京大学前身）：成立于1898年7月3日，是中国近代第一所国立大学。

2. 北洋大学堂（天津大学前身）：成立于1895年，标志着中国近代教育的新篇章。

3. 清华学堂（清华大学前身）：成立于1911年，是清政府建立的留美预备学校，后更名为清华学校，1928年升格为国立清华大学。

4. 四川高等学堂（四川大学前身）：成立于1902年，由四川总督在1896年创办的西式学堂发展而来。

还有一些其他重要的大学，如山西大学堂、福建船政学堂、上海交通大学（南洋公学前身）、武汉大学（自强学堂前身）等。

综上所述，清朝时期中国的高等教育体系开始发展，出现了几所重要的大学，其中包括京师大学堂（北京大学前身）、北洋大学堂（天津大学前身）、山西大学堂、福建船政学堂、上海交通大学（南洋公学前身）、武汉大学（自强学堂前身）等。此外，还有一些教会大学，如圣约翰大学等，在晚清时期为中国社会培养了众多人才。