根据最新的可靠数据来源，各专业发表论文数量排名如下：

临床医学：

以超过43000篇的卓越科技论文数量位居第一。

化学：

在多个学科中表现突出，数量较多。

生物学：

同样在多个学科中表现突出，数量较多。

电子、通讯与自动控制：

卓越科技论文数量较多。

物理学：

浙江大学的物理学学科在国际上认可度极高，发文数量也较多。

材料科学与工程：

浙江大学在该领域发文数量相对较多。

工程学：

浙江大学和上海交通大学在该领域发文数量较多。

农业与生物技术：

浙江大学在该领域发文数量相对较多。

计算机科学：

在高质量国际论文统计中表现突出，数量较多。

环境与生态学：

在高质量国际论文统计中表现突出，数量较多。

这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了各专业的论文发表数量和影响力。建议进一步查阅相关期刊和机构的详细报告，以获得更全面的了解。