南京中医药大学的王牌专业主要包括以下几个：

中医学：

根据教育部全国第四轮学科评估结果，中医学是南京中医药大学最牛的专业之一。

中药学：

中药学也是南京中医药大学最牛的专业之一，并且是国家重点学科和双一流建设学科。

中西医结合：

虽然具体排名未明确列出，但根据教育部的学科评估结果，中西医结合也是南京中医药大学的重要专业。

针灸推拿学：

该专业是国家级特色专业，推荐指数高，显示其受欢迎程度。

药学：

药学类专业包括药学、药物制剂等，是南京中医药大学的重要专业之一。

护理学：

护理学是国家级特色专业，具有广泛的认可度。

中药资源与开发：

该专业被评为国家一流专业建设点、国家特色专业、教育部一流学科及江苏省优势学科建设专业，在全国排名中位于第1名，评级为A+级。

中医儿科学：

该专业在全国排名中位于第1名，评级为A+级。

中医养生学：

该专业在全国排名中位于第1名，评级为A+级。

中医康复学：

该专业在全国排名中位于第1名，评级为A+级。

这些专业在教学、研究和临床实践方面都有较高的水平和广泛的社会认可。建议学生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业。