南京药学专业排名如下：

中国药科大学：

全国排名191，区域一流高校，也是国家“211工程”高校之一。

南京医科大学：

全国排名130，中国知名高校，其附属医院是江苏省最好的医院之一——江苏省人民医院。

南京中医药大学：

全国排名388，区域知名高校。

建议：

中国药科大学和 北京大学在药学专业的排名中位列前茅，具有较高的权威性和学术实力，是药学专业的顶尖学府。

南京医科大学在临床医学和药学领域均有较高的声誉，其附属医院在医疗水平上也是国内顶尖。

南京中医药大学在中医药领域具有显著优势，其多个药学相关专业的排名在全国名列前茅。

具体选择哪所学校，建议根据个人兴趣、职业规划以及学校的学科优势进行综合考虑。