根据最新的排名，全国植物保护专业最好的大学如下：

1. 南京农业大学（排名第1）

2. 浙江大学（排名第2）

3. 中国农业大学（排名第3）

4. 福建农林大学（排名第4）

5. 华中农业大学（排名第5）

6. 贵州大学（排名第6）

7. 西北农林科技大学（排名第7）

8. 山东农业大学（排名第8）

9. 华南农业大学（排名第9）

10. 西南大学（排名第10）

这些大学在植物保护领域具有很高的教学和研究水平，为学生提供了良好的学习环境和实践机会。