截至2024年，根据不同的排名来源，自动化制药工程专业的排名如下：

天津大学

华东理工大学

清华大学

北京化工大学

大连理工大学

南京工业大学

浙江大学

北京理工大学

哈尔滨工业大学

南京理工大学

此外，其他一些值得关注的大学包括：

四川大学

中国药科大学

沈阳药科大学

西北农林科技大学

这些排名综合了不同来源的数据，因此排名可能有一定的波动。建议在选择学校时，可以综合考虑学校的教学质量、研究实力、师资力量以及个人的职业规划。