在专业课三门中选两门时，你可以从以下几个方面进行考虑：

个人优势

选择自己擅长的科目可以增加得分的机会。如果你在某个领域有较好的基础和兴趣，那么选择这个科目会让你在考试中更加得心应手。

科目难度

根据自己的学习情况和备考程度，选择难度适中的科目。如果你对某个科目感到特别困难，可能会影响你的整体成绩，因此选择较为熟悉的科目会更有利于你。

专业要求

不同的专业或研究方向可能对科目有特定的要求。例如，某些专业可能要求必须选择某些科目，或者对某些科目有更高的权重。因此，选择时要结合自己的专业背景和目标专业的具体要求。

考试策略

考虑各科目题型的难易程度及分值分布，制定合理的考试策略。不同的科目可能有不同的题型和分值比例，了解这些信息可以帮助你更好地分配复习时间和精力。

交叉知识

虽然选择哪两门科目差别不大，但知识之间可能存在交叉。选择时可以考虑这些交叉点，可能会对你的复习和考试有所帮助。

未来发展方向

如果你已经明确了自己的职业规划和研究方向，可以根据这些信息来选择科目。选择与你未来发展方向相关的科目，可能会让你在研究生阶段的学习和工作中更加顺利。

综合以上几点，你可以更有针对性地选择适合自己的科目组合。同时，建议多参考目标院校的招生简章和考试大纲，了解具体的科目设置和考试要求，以确保你的选择符合实际情况。