以下是微生物系专业的大学排名情况：

北京大学

清华大学

上海交通大学

中国农业大学

南京大学

中国科学技术大学

武汉大学

华中农业大学

南开大学

东北师范大学

请注意，这些排名可能会随着时间和不同评估机构的评定标准而有所变化。建议查询权威的教育评估机构发布的最新数据以获取最准确的信息。