以下是微生物系专业的大学排名情况：

北京大学

清华大学

上海交通大学

中国科学技术大学

武汉大学

华中农业大学

南京大学

复旦大学

浙江大学

南开大学

中山大学

四川大学

华中科技大学

厦门大学

天津大学

华东理工大学

北京师范大学

首都师范大学

东北师范大学

江南大学

山东大学

南京农业大学

中国农业大学

武汉病毒所

中科院微生物所

这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了各学校在微生物领域的科研实力、教学水平和学术声誉。建议学生在选择学校时，可以综合考虑这些排名信息，同时也要结合自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的学校和专业。