吉首大学的专业排名如下：

湖南省重点学科

民族学、哲学、体育学、生态学、应用经济学

国家级特色专业

工商管理、生物科学、音乐学

省级特色专业

市场营销、工商管理、生物科学、食品科学与工程、舞蹈学、音乐学、体育教育、新闻学

校级重点学科

工商管理、思想政治教育

校级重点建设学科

马克思主义理论

校友会版王牌专业排名（研究型）

武术与民族传统体育（全国第5名）、网络与新媒体（全国第5名）、旅游管理（全国第22名）、体育教育（全国第23名）、物理学（全国第33名）、化学（全国第39名）、音乐学（全国第39名）、软件工程（全国第44名）、计算机科学与技术（全国第60名）、汉语言文学（全国第64名）

校友会版王牌专业排名（应用型）

软件工程（全国第45位）、临床医学（全国第97位）、土木工程（全国第97位）、化学工程与工艺（全国第92位）、计算机科学与技术（全国第129位）、音乐学（全国第129位）

国家级一流本科专业

经济学、英语、网络与新媒体、数学与应用数学、生物科学、食品科学与工程、工商管理、音乐学

省级一流本科专业

思想政治教育、小学教育、电子信息工程

热门专业

软件工程、临床医学、电子信息工程、通信工程、统计学、机械设计制造及其自动化、金融工程、物理学（师范类）、生物科学（师范类）、土木工程

这些排名综合了不同来源的数据，并考虑了专业在不同评价标准下的表现。建议考生在选择专业时，可以综合考虑自己的兴趣、职业规划以及各专业在行业中的需求和发展前景。