根据最新的排名信息，2024年中国导弹设计工程专业的大学排名如下：

北京航空航天大学

西北工业大学

哈尔滨工业大学

南京航空航天大学

国防科技大学

北京理工大学

空军工程大学

清华大学

沈阳航空航天大学

海军航空大学（原海军航空工程学院）

这些排名基于综合指数，其中北京航空航天大学位列榜首。国防科技大学在导弹设计专业中也非常突出，拥有导弹工程系，并开设了导弹总体设计、导弹控制设计、导弹发动机设计等多个专业。

建议优先考虑北京航空航天大学、西北工业大学和哈尔滨工业大学，因为它们在导弹设计专业排名中位列前三，显示出其在这一领域的较强实力。