军事工程学院开设的专业主要包括以下几类：

管理工程

武器系统与发射工程

指挥自动化工程

计算机科学与技术

信息工程

舰船动力工程

核动力工程

电子工程

护理学

机械工程及其自动化

电气工程及其自动化

应用物理学

系统工程

装备经济管理

电子科学与技术

信息与通信工程

武器系统与工程（航空军械技术与指挥）

无人装备工程（无人机航电系统技术与指挥）

指挥信息系统工程

电气工程及其自动化（航空特设、计量技术与指挥）

软件工程

光学工程

兵器科学与技术

仪器科学与技术

控制科学与工程

土木工程

这些专业涵盖了军事工程领域的各个方面，从基础工程到高级技术应用，从管理科学到作战指挥等。具体开设的专业可能会根据各军事工程学院的侧重点和需求有所不同。建议直接咨询相关军事工程学院或查看其官方网站以获取最准确的专业设置信息。