南京大学应用经济学专业在全国的排名情况如下：

2023年中国大学一流学科排名中，南京大学应用经济学学科全国排名第17位。

2024年南京经济学专业的大学排名中，南京大学位列全国第8位。

建议您根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑学校的师资力量、教学资源、研究实力以及就业前景等因素，选择最适合自己的学校。