以下是日本农业机械化专业排名较高的大学：

东京大学：

东京大学的农学生命科学研究科在农学专业中享有很高的声誉，其农学院的前身是驹场农学校，于1876年开设了农学部。

京都大学：

京都大学在农业科学领域同样具有很高的学术地位，是日本顶尖的研究型国立综合大学之一。

北海道大学：

作为日本著名的国立大学，北海道大学在农学和生命科学领域具有很强的研究能力，是历史上七所日本帝国大学之一。

东京农工大学：

东京农工大学拥有农学部和工学部，是日本著名的国立大学，于1874年建立，1949年开设大学教育。

东北大学：

东北大学在农业工程领域也有很好的排名，是日本顶尖的综合性研究型大学之一。

九州大学：

九州大学在农业科学和工程领域同样表现出色，其农业专业在世界上排名较高。

这些大学在农业机械化专业方面都有较高的声誉和研究实力，建议根据具体兴趣和职业规划选择合适的大学。