当前上海在崇明岛上的大学有：

上海交通大学崇明校区：

以农业、生态、全健康、低碳以及近源学科为重点，规划全日制在校生约2000人。

上海外国语大学贤达经济人文学院崇明校区：

以语言和经济类学科为重点的应用技术型大学。

上海电视大学崇明分校：

崇明区唯一的大学，属于崇明团校的一部分。

上海大学崇明校区。

东华大学崇明校区。

上海海洋大学崇明校区。

这些校区共同构成了崇明大学城，是上海市高等教育备受关注的示范区之一。