南京农业大学的微生物学专业在全国高校同专业排名中属于 第二梯队。之前曾号称第五，但排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化。此外，南京农业大学的微生物学学科在2020年QS世界大学科目排名中位列第26位，并且有多个相关学科领域进入ESI全球前1%。

综合以上信息，南京农业大学的微生物学专业在全国高校中属于较高的水平，是一个值得考虑的选择。建议进一步查阅最新的排名信息和学校的官方公告，以获取最准确的排名数据。