李昌钰最初的专业是 警察学。他在1957年高中毕业考入台湾中央警官学院，所学专业为警察学，并于1960年以全班第二名的成绩毕业。之后，他赴美国留学，在1972年在纽约市立大学约翰·杰伊学院刑事科学系取得学士学位，之后获得生物化学及分子化学硕士学位（1974年）和博士学位（1975年）。尽管他后来取得了生物化学博士学位，但他更倾向于刑事鉴识科学，并在该领域取得了极高的成就。