在江西省选择公办二本院校的专业时，可以考虑以下几个方面：

个人兴趣 ：选择自己感兴趣的专业会更有利于未来的发展。兴趣是最好的老师，能够让你在学习过程中保持热情和动力。

专业热门度与就业前景

热门专业：

如软件工程、计算机科学与技术、临床医学等，这些专业由于应用广泛，就业前景通常较好，但竞争也较为激烈。

传统专业：如师范类专业（学前教育、小学教育等），这些专业虽然录取门槛相对较低，但就业稳定，且社会需求较大。

行业需求与发展空间：选择当前及未来一段时间内需求较大的专业，能够提高就业率。同时，考虑行业的发展趋势和空间，选择有长期发展潜力的专业。

学校特色与实力

特色专业：每所二本大学都有其特色专业，如南京工程学院的电子信息工程、机械设计制造及其自动化，金陵科技学院的车辆工程、软件工程等。

学科实力：了解学校的学科实力和教学质量，选择实力较强的专业，能够获得更好的教育资源。

地域因素

地理位置：不同地区的二本大学在专业设置和就业前景上存在差异。例如，东部沿海地区的大学可能在对外贸易、海洋科学等领域具有优势，而中西部地区的大学可能在资源开发、工程技术等方面更胜一筹。

录取难度

录取分数：了解不同专业的录取分数，选择自己能够达到的志愿，确保能够被录取。

录取率：参考往年的录取率，了解专业的录取难度，选择把握较大的专业。

职业规划 ：结合自己的职业规划，选择有利于未来职业发展的专业，能够提高就业竞争力。

行业需求与发展空间

行业需求：

选择当前及未来一段时间内需求较大的专业，能够提高就业率。

发展空间：考虑行业的发展趋势和空间，选择有长期发展潜力的专业。

综合以上因素，建议你在选择专业时，先明确自己的兴趣和职业规划，然后结合各专业的热门度、就业前景、学校特色与实力、地域因素以及录取难度等方面进行综合考虑，以选择最适合自己的专业。