截至2024年，内蒙古自治区共有 54所大学。其中包括1所211院校（内蒙古大学）和4所省部共建院校（内蒙古科技大学、内蒙古农业大学、内蒙古医科大学、内蒙古民族大学）。本科院校有17所，专科学校有37所。

这些大学中，比较有名的包括内蒙古大学、内蒙古科技大学、内蒙古工业大学、内蒙古农业大学、内蒙古医科大学、内蒙古师范大学、内蒙古民族大学、赤峰学院、内蒙古财经大学、呼伦贝尔学院、集宁师范学院、河套学院、呼和浩特民族学院、内蒙古艺术学院、鄂尔多斯应用技术学院等。