石工院的专业排名如下：

石油工程：

西南石油大学的王牌专业，项目编号为TS2365，所在学院为石工院，批准时间为2007年。

应用化学：

西南石油大学的王牌专业，项目编号为TS10513，所在学院为化工院，批准时间为2007年。

机械工程及自动化：

西南石油大学的王牌专业，项目编号为TS1Z103，所在学院为机电院，批准时间为2007年。

这些专业在石工院中具有较高的排名和声誉，建议学生在选择专业时优先考虑这些专业。